Disdukcapil sudah melakukan kerjasama dengan beberapa instansi terkait guna peningkatan kualitas cakupan penerbitan dokumentasi Kependudukan dan Pencatatan Sipil. Kerjasama dengan Pengadilan Agama ini adalah yang ke-11, sebelumnya pada 2017 dengan PT.Pos Indonesia, RS Medika Sangatta, RS PKT Prima Sangatta, RS Meloy, RS Asy-Syifa, RSIA Cahaya Sangatta, Bidan Praktik Triana, Dewan Pastoral Paroki Muara Wahau, Yayasan Keluarga Kampung Hijau dan Kementerian Agama Kutim. Selain itu Disdukcapil juga sudah melakukan MoU (Momerandumof Understanding) dengan Persekutuan Gereja-Gereja di Indonesia (PGI) wilayah Kutim, Gereja Katolik Paroki St Paulus Long Bentuk Busang, Gereja Katolik St Yosef Bontang dan Gereja Katolik St Theresia Sangatta.
Disdukcapil juga sudah menerapkan inovasi pelayanan sejak 2018 diantaranya PELUK AKU (Pelayanan Kependudukan Akta Kutamakan), GEMAS AKU ( Gerakan Masyarakat Sadar Administrasi Kependudukan), ULAR SARI (Urusan Kelar Sehari), LAPONTE (Layanan Administrasi Kependudukan di Pondok Pesantren) dan LAREJA (Layanan Adminstrasi Kependudukan di Gereja). (hms4)
